用途上的区别：
无水三氯化铁用途：有机合成催化剂。分析铜、硒和砷，测定酚、胆固醇和胆碱时作指示剂；用于污水处理、线路板蚀刻、不锈钢腐蚀以及媒染剂，是固体三氯化铁的良好替代品，其中HPFCS高纯型用于电子行业高要求的清洗及蚀刻；是城市污水及工业废水处理的高效廉价絮凝剂。
六水三氯化铁：广泛用于水处理、有机合成催化剂，同时用于染料、医药工业。三氯化铁溶液广泛应用于蚀刻。用作净水剂、刻蚀剂、防水剂，制造其他铁盐和墨水。还用作媒染剂、催化剂、氧化剂、氯化 剂、着色剂，凝聚剂。
化学式的区别：
无水三氯化铁：化学式是FeCl3，相对分子质量：六水合物是270.21，无水物是162.21。熔点306℃、沸点315℃。
六水三氯化铁：分子式是H12Cl3FeO6，熔点37℃，沸点280-285℃。
含义上的区别：
无水三氯化铁：是一种共价化合物。又名三氯化铁，易溶于水并且有强烈的吸水性，能吸收空气里的水分而潮解，由六水三氯化铁失去六个结晶水制得。
六水三氯化铁是化学物质：溶于水、醇、丙酮，醚和甘油等。水溶液呈酸性，能使蛋白质凝固。